Application Note MetaXpressハイコンテント画像取得・解析ソフトウェア用
カスタムモジュールエディター
- MetaXpressハイコンテント画像取得・解析ソフトウェア用カスタムモジュールエディター
- シンプルなステップバイステップのカスタム解析を作成
- 対物レンズのセグメンテーションと分類の調整
- 特殊なセル区画内に局在する対物レンズの検索
- 目的の測定値のみをレポート
PDF版(英語)
はじめに
MetaXpressハイコンテント画像取得・解析ソフトウェアについて
MetaXpress®ソフトウェアのバージョン5のカスタムモジュールエディターは、画像解析のためのテンプレートを作成し、テストすることができる柔軟でインタラクティブな環境です。処理オプション、モルフォロジーフィルタ、アプリケーションモジュール、セグメンテーションメソッドのギャラリーが用意されており、ユーザーは一連の解析ステップを構築することができます。新しいClick-to-Findツールは、対物レンズの識別を容易にし、ステップカードパラメータを自動入力します。一度作成したカスタムモジュールは簡単に共有でき、他の画像セットの解析に再利用できます。
一般的および特異的な毒性パラメーターを測定するためのカスタムモジュールを迅速に作成できます。細胞生存率、アポトーシス、オートファジー、ミトコンドリア膜電位のモニタリングに加え、カスタムモジュールを使用すれば、組織特異的な毒性作用も同時に解析できます。どの反応を検出するか、またどの測定値を記録するかはユーザーが決定します。
カスタムモジュールエディターにより、物体内の対物レンズの識別、形状解析のための形態計測分類器の作成、カラー画像と透過光画像の解析など、より多くの解析が可能になる。カスタムモジュールを使用することで、研究者はセグメンテーションステップを簡略化し、選択されたデータのみをレポートすることができるため、不必要な解析時間を節約することができる。MetaXpress® PowerCore™ソフトウェアを使用した並列処理を利用することで、解析時間をさらに短縮することができます。
セル遊走カスタム解析
異なる表面処理を施したオリスセル遊走アッセイ(Platypus Technologies, LLC製)(AとB)。カスタムモジュールを用いると、無細胞領域への遊走を正確に測定できるだけでなく、ピペッティングアーチファクト(C)を画像解析から省くことができる。神経突起伸長における点刻の検出
上の写真は、神経突起伸長における点刻をカウントするカスタムモジュールである。追加で記録したパラメータは、セルあたりの核の数とアウトグロースの数である。セグメンテーションのオーバーレイは、黄色:神経突起、紺色の点:シナプスペプチド、ピンク:核を示す。カスタムモジュールは非神経核を解析から除外した。
カスタムモジュールの作成
カスタムモジュールエディターを用いて、核内の顆粒を検出するカスタムモジュールのサンプルを示す。
- セグメントタブでraw画像を選択する。
- 新しいClick-to-Findツールを使って核を特定する。対象オブジェクトをクリックするだけで、測定パラメータが自動的に更新されます。
- 顆粒検出でスポットを見つける。
- 核マスク内の顆粒のみを測定します。
核内の顆粒検出
上の写真は、神経突起伸長における点刻をカウントするカスタムモジュールです。追加のパラメータとして、細胞あたりの核の数とアウトグロースの数を記録した。セグメンテーションのオーバーレイは、黄色:神経突起、紺色の点:シナプスペプチド、ピンク:核を示す。カスタムモジュールは非神経核を解析から除外した。肝細胞のマルチパラメーター毒性測定
マルチパラメーター毒性モジュールの1つのステップでは、核の数、サイズ、アポトーシス核の数に基づいて細胞を特徴付けることができる(画像は示さず)。別のステップでは、セル面積を測定し、細胞質内に存在するミトコンドリアを定量化する。
マルチパラメーター肝毒性評価の測定例:
- 核の総数
- アポトーシス核数
- 核のサイズ
- 生存細胞数(生存率)
- ミトコンドリア数/セル(細胞質内の顆粒を数える)
- リン脂質の総量/セル
IC50曲線:ミトコンドリア数/セル
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