Application Note QPix 460自動微生物コロニーピッカーシステムで、カスタマイズ可能なプレーティングパターンを活用し、
サンプルハンドリングの柔軟性を向上

  • カスタマイズ可能なプレーティングパターンは、柔軟性を提供し、プレーティングに使用される寒天充填トレイでの交差汚染を防止します。
  • 複数サンプルの正確なプレーティングとスプレッディング
  • プレーティングからスプレッディング、ピッキングまでの全自動ワークフロー
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はじめに

寒天充填QTrayは、細菌コロニーの大規模培養やスクリーニングに使用されます。48ウェルの仕切り板を追加することで、複数の細菌サンプルを同じQTray上で別々に培養することができます(図1左)。通常、QPix 460へのプレーティングは、仕切り付きQTrayを使用して簡単に行うことができます。しかし、仕切りのないQTrayでも複数の細菌サンプルを培養することは可能ですが、交差汚染に関する懸念を克服する必要があります。このノートでは、サンプル間の交差汚染の可能性を最小限に抑えながら、QPix™ 460のカスタマイズプレーティングを使用して、仕切りなしのQTraysにプレーティングする方法を紹介します。

QPix 460自動微生物コロニーピッカーは、寒天を充填したQTrayにサンプルをプレーティングする機能を備えています。96サンプルを30分でプレーティングできます。QPix 460のデフォルトのプレーティングパターンは、仕切り付きの寒天入りQTrayのプレーティング用に設計されています。しかし、QPix 460ソフトウェアのPlating Pattern Editorプロセスにより、ユーザーはカスタムプレーティングパターンを柔軟に作成できます。これにより、仕切りのない寒天入りQTrayにプレーティングする際に、汚染を防ぐために十分なサンプル間隔を確保できる、より小さなプレーティングパターンを作成することが可能になります。

図1. 寒天入りQトレイ。仕切りのあるQTray(左)と仕切りのないQTray(右)を示す。

カスタムプレーティングパターンの作成

Plating Pattern Editorは、QPix 460ソフトウェアのPlating Processesの下にあります(図2)。Plating Editorウィンドウで、カスタムプレーティングパターンを作成し、追加することができます(図3)。

図2. QPix 460ソフトウェアのメインウィンドウ。めっきパターンエディター(赤で囲んだ部分)は、QPix 460ソフトウェアのめっきプロセスの下にあります。

図2. QPix 460ソフトウェアのメインウィンドウ。プレーティングパターンエディター(赤で囲んだ部分)は、QPix 460ソフトウェアのプレーティングプロセスの下にあります。

図3. めっきパターン編集ウィンドウ。めっきパターンは正方形のグリッド領域内に作成されます。追加をクリックすると、カスタムめっきパターンが保存され、QPix 460で使用できるようになります。

図3. プレーティング・パターン編集ウィンドウ。正方形のグリッド領域内にプレーティングパターンが作成されます。追加をクリックすると、カスタムプレーティングパターンが保存され、QPix 460で使用できるようになります。

QTrayへの大腸菌プレーティング

パーシャルスパイラルプレーティングパターン(図4B)を作成した後、QPix 460のプレーティングプロセスとスプレッディングヘッドおよびピンを使用して、様々な濃度で希釈した大腸菌をLB寒天培地QTray(仕切りなし)にプレーティングしました。QPix 460は、各大腸菌サンプルを40µlずつピペッティングし、部分スパイラルプレーティングパターンを使用するようにプログラムされていました。

プレーティング後、QTrayを37℃で一晩培養した。翌日、QPix 460でQTray全体を白色光イメージングした(図5Bおよび6B)。

Figure 4. Full and partial spiral plating pattern. A) The default full spiral pattern provided in the QPix software. B) The use of the Plating Pattern Editor in the QPix software allows for the creation of a partial spiral plating pattern that can be used for plating QTrays that do not have dividers.

図4. フルスパイラルおよび部分スパイラルプレーティングパターン。A) QPixソフトウェアで提供されるデフォルトのフルスパイラルプレーティングパターン。B) QPixソフトウェアのプレーティングパターン編集機能を使用すると、仕切りのないQTrayのプレーティングに使用できる部分的なスパイラルプレーティングパターンを作成できます。

図5. QTray全体の画像。A)標準カメラ画像、B)大腸菌濃度の異なる部分スパイラルパターンを用いてプレーティングしたQTrayのQPix 460白色光画像。

図5. QTray全体の画像。A)標準カメラ画像、B)大腸菌濃度の異なる部分スパイラルパターンを用いてプレーティングしたQTrayのQPix 460白色光イメージング画像。

黄色の枠で囲った部分の拡大図を図6に示す。

図6. 図4で撮影したQTray上にプレーティングした最高濃度の大腸菌サンプル8種の拡大図。A) 標準カメラおよびB) QPix 460白色光拡大画像を示す。これらのサンプルは互いに明確に分離しており、交差汚染は観察されなかった。

図6. 図4で撮影したQTray上にプレーティングした最高濃度の大腸菌サンプル8種の拡大図。A) 標準カメラおよびB) QPix 460白色光イメージング。これらのサンプルは互いに明確に分離しており、交差汚染は観察されなかった。

結論

部分的なスパイラルプレーティングパターンを用いると、各サンプル間に十分なスペースがあるため、サンプル間のコロニーの増殖は観察されず、サンプルは分離されたままである。このことから、QPix 460は、仕切りのあるQTrayだけでなく、仕切りのないQTrayにもクロスコンタミネーションなしに複数のサンプルをプレーティングできることがわかります。同じ部分プレーティングパターン法は、Nunc™ OmniTrays™にも適応できます。

製品 構成 カタログ番号
QPix 460 微生物コロニーのハイスループットスクリーニングおよび対物セレクションシステム お問い合わせ
通気性Qトレイ、カバー付き、ポリスチレン、240 x 240 x 20 mm 1ケース20個入り X6023
通気性Qトレイ、カバー付き、48ウェルディバイダー、ポリスチレン、242 x 240 x 20 mm 1ケース20枚入り X6029
ストリーキングヘッド用交換ピン 1個あたり X4330
ストリーキングヘッド 8ピン 8ピン - 直径3.0 mm X4345
130 µL ARTピペットチップ 10箱入り T0130
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