Application Note QPix 460でサンプルハンドリングを最適化

  • カスタマイズ可能なプレーティングパターンにより、柔軟性を確保し、寒天を充填したトレイでのプレーティング時にクロスコンタミネーションを防ぎます
  • 複数サンプルの正確なプレーティングとスプレッディングを実現します
  • プレーティングからスプレッディング、ピッキングまで、完全自動化されたワークフローを提供します
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はじめに

寒天を充填したQTrayは、細菌コロニーの大規模な培養とスクリーニングに使用されます。48ウェルディバイダーを追加することで、複数の細菌サンプルを同じQTray上で個別に培養することができます(図1 左)。通常、QPix™ 460でのプレーティングはディバイダー付きQTrayを用いることで容易に実施できます。しかし、ディバイダーなしのQTrayでも複数の細菌サンプルを培養することは可能ですが、クロスコンタミネーションへの懸念を解消する必要があります。本ノートでは、QPix460のカスタマイズされたプレーティング機能を活用し、ディバイダーなしのQTrayにプレーティングを行いながら、サンプル間のクロスコンタミネーションを最小限に抑える方法をご紹介します。

QPix 460 自動微生物コロニー選択装置は、寒天を充填したQTrayへのサンプルプレーティングが可能です。96サンプルを30分でプレーティングできます。QPix 460のデフォルトのプレーティングパターンは、ディバイダー付きQTray用に設計されています。しかし、QPix 460ソフトウェアのPlating Pattern Editorを使用することで、カスタムプレーティングパターンを作成する柔軟性が得られます。これにより、ディバイダーなしのQTrayにプレーティングする際、サンプル間に十分な間隔を確保し、コンタミネーションを防ぐための小さなプレーティングパターンを作成できます。

図1. 寒天を充填したQTray ディバイダー付き(左)とディバイダーなし(右)のQTrayを示します。

カスタムプレーティングパターンの作成

Plating Pattern Editorは、QPix 460ソフトウェアのPlating Processes内にあります(図2)。Plating Editorウィンドウで、カスタムプレーティングパターンを作成し、追加することができます(図3)。

図2. QPix 460ソフトウェアのメインウィンドウ。めっきパターンエディター(赤で囲んだ部分)は、QPix 460ソフトウェアのめっきプロセスの下にあります。

図2. QPix 460ソフトウェアのメインウィンドウ 赤丸で囲まれたPlating Pattern Editorは、Plating Processes内にあります。

図3. めっきパターン編集ウィンドウ。めっきパターンは正方形のグリッド領域内に作成されます。追加をクリックすると、カスタムめっきパターンが保存され、QPix 460で使用できるようになります。

図3. Plating Pattern Editorウィンドウ プレーティングパターンは四角いグリッドエリア内で作成します。「追加」をクリックすると、カスタムプレーティングパターンが保存され、QPix 460で使用可能になります。

QTrayへのE.coliプレーティング

部分スパイラルプレーティングパターン(図4B)を作成後、QPix 460のプレーティングプロセスを使用し、スプレッディングヘッドとピンを組み合わせて、さまざまな濃度に希釈したE.coliをディバイダーなしのLB寒天QTrayにプレーティングしました。QPix 460は各E.coliサンプルを40µLピペットし、部分スパイラルプレーティングパターンを使用するように設定しました。

プレーティング後、QTrayは37°Cで一晩インキュベートしました。翌日、QPix 460で白色光イメージングを行い、QTray全体をイメージングしました(図5Bおよび図6B)。

Figure 4. Full and partial spiral plating pattern. A) The default full spiral pattern provided in the QPix software. B) The use of the Plating Pattern Editor in the QPix software allows for the creation of a partial spiral plating pattern that can be used for plating QTrays that do not have dividers.

図4. フルスパイラルと部分スパイラルプレーティングパターン A) QPixソフトウェアで提供されるデフォルトのフルスパイラルパターン。B) Plating Pattern Editorを使用して作成した部分スパイラルパターンは、ディバイダーなしのQTrayへのプレーティングに利用できます。

図5. QTray全体の画像。A)標準カメラ画像、B)大腸菌濃度の異なる部分スパイラルパターンを用いてプレーティングしたQTrayのQPix 460白色光画像。

図5. QTray全体の画像 A) 標準カメラ画像、B) QPix 460による白色光画像。部分スパイラルパターンを用いて異なる濃度のE.coliをプレーティングしたQTrayを示します。

黄色枠部分の拡大図は図6に示します。

図6. 図4で撮影したQTray上にプレーティングした最高濃度の大腸菌サンプル8種の拡大図。A) 標準カメラおよびB) QPix 460白色光拡大画像を示す。これらのサンプルは互いに明確に分離しており、交差汚染は観察されなかった。

図6. 図4でイメージングしたQTray上のE.coli高濃度8サンプルの拡大図 A) 標準カメラ画像、B) QPix 460による白色光拡大画像。各サンプルは明確に分離しており、クロスコンタミネーションは認められません。

結論

部分スパイラルプレーティングパターンを使用することで、各サンプル間に十分なスペースが確保され、サンプル同士が混ざることなく、コロニーの成長も認められませんでした。これにより、QPix 460はディバイダー付きQTrayだけでなく、ディバイダーなしのQTrayにもクロスコンタミネーションなしで複数サンプルをプレーティングできることが示されました。同じ部分プレーティングパターンの方法は、Nunc™ OmniTrays™にも適用可能です。

製品 構成 カタログ番号
QPix 460 微生物コロニーのハイスループットスクリーニングおよび対物セレクションシステム お問い合わせ
通気性Qトレイ、カバー付き、ポリスチレン、240 x 240 x 20 mm 1ケース20個入り X6023
通気性Qトレイ、カバー付き、48ウェルディバイダー、ポリスチレン、242 x 240 x 20 mm 1ケース20枚入り X6029
ストリーキングヘッド用交換ピン 1個あたり X4330
ストリーキングヘッド 8ピン 8ピン - 直径3.0 mm X4345
130 µL ARTピペットチップ 10箱入り T0130

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