Application Note QPix 460でサンプルハンドリングを最適化
- カスタマイズ可能なプレーティングパターンにより、柔軟性を確保し、寒天を充填したトレイでのプレーティング時にクロスコンタミネーションを防ぎます
- 複数サンプルの正確なプレーティングとスプレッディングを実現します
- プレーティングからスプレッディング、ピッキングまで、完全自動化されたワークフローを提供します
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はじめに
寒天を充填したQTrayは、細菌コロニーの大規模な培養とスクリーニングに使用されます。48ウェルディバイダーを追加することで、複数の細菌サンプルを同じQTray上で個別に培養することができます(図1 左)。通常、QPix™ 460でのプレーティングはディバイダー付きQTrayを用いることで容易に実施できます。しかし、ディバイダーなしのQTrayでも複数の細菌サンプルを培養することは可能ですが、クロスコンタミネーションへの懸念を解消する必要があります。本ノートでは、QPix460のカスタマイズされたプレーティング機能を活用し、ディバイダーなしのQTrayにプレーティングを行いながら、サンプル間のクロスコンタミネーションを最小限に抑える方法をご紹介します。
QPix 460 自動微生物コロニー選択装置は、寒天を充填したQTrayへのサンプルプレーティングが可能です。96サンプルを30分でプレーティングできます。QPix 460のデフォルトのプレーティングパターンは、ディバイダー付きQTray用に設計されています。しかし、QPix 460ソフトウェアのPlating Pattern Editorを使用することで、カスタムプレーティングパターンを作成する柔軟性が得られます。これにより、ディバイダーなしのQTrayにプレーティングする際、サンプル間に十分な間隔を確保し、コンタミネーションを防ぐための小さなプレーティングパターンを作成できます。

図1. 寒天を充填したQTray ディバイダー付き(左)とディバイダーなし(右)のQTrayを示します。
カスタムプレーティングパターンの作成
Plating Pattern Editorは、QPix 460ソフトウェアのPlating Processes内にあります(図2)。Plating Editorウィンドウで、カスタムプレーティングパターンを作成し、追加することができます(図3)。

図2. QPix 460ソフトウェアのメインウィンドウ 赤丸で囲まれたPlating Pattern Editorは、Plating Processes内にあります。

図3. Plating Pattern Editorウィンドウ プレーティングパターンは四角いグリッドエリア内で作成します。「追加」をクリックすると、カスタムプレーティングパターンが保存され、QPix 460で使用可能になります。
QTrayへのE.coliプレーティング
部分スパイラルプレーティングパターン(図4B)を作成後、QPix 460のプレーティングプロセスを使用し、スプレッディングヘッドとピンを組み合わせて、さまざまな濃度に希釈したE.coliをディバイダーなしのLB寒天QTrayにプレーティングしました。QPix 460は各E.coliサンプルを40µLピペットし、部分スパイラルプレーティングパターンを使用するように設定しました。
プレーティング後、QTrayは37°Cで一晩インキュベートしました。翌日、QPix 460で白色光イメージングを行い、QTray全体をイメージングしました(図5Bおよび図6B)。

図4. フルスパイラルと部分スパイラルプレーティングパターン A) QPixソフトウェアで提供されるデフォルトのフルスパイラルパターン。B) Plating Pattern Editorを使用して作成した部分スパイラルパターンは、ディバイダーなしのQTrayへのプレーティングに利用できます。

図5. QTray全体の画像 A) 標準カメラ画像、B) QPix 460による白色光画像。部分スパイラルパターンを用いて異なる濃度のE.coliをプレーティングしたQTrayを示します。
黄色枠部分の拡大図は図6に示します。

図6. 図4でイメージングしたQTray上のE.coli高濃度8サンプルの拡大図 A) 標準カメラ画像、B) QPix 460による白色光拡大画像。各サンプルは明確に分離しており、クロスコンタミネーションは認められません。
結論
部分スパイラルプレーティングパターンを使用することで、各サンプル間に十分なスペースが確保され、サンプル同士が混ざることなく、コロニーの成長も認められませんでした。これにより、QPix 460はディバイダー付きQTrayだけでなく、ディバイダーなしのQTrayにもクロスコンタミネーションなしで複数サンプルをプレーティングできることが示されました。同じ部分プレーティングパターンの方法は、Nunc™ OmniTrays™にも適用可能です。
| 製品 | 構成 | カタログ番号 |
|---|---|---|
| QPix 460 | 微生物コロニーのハイスループットスクリーニングおよび対物セレクションシステム | お問い合わせ |
| 通気性Qトレイ、カバー付き、ポリスチレン、240 x 240 x 20 mm | 1ケース20個入り | X6023 |
| 通気性Qトレイ、カバー付き、48ウェルディバイダー、ポリスチレン、242 x 240 x 20 mm | 1ケース20枚入り | X6029 |
| ストリーキングヘッド用交換ピン | 1個あたり | X4330 |
| ストリーキングヘッド 8ピン | 8ピン - 直径3.0 mm | X4345 |
| 130 µL ARTピペットチップ | 10箱入り | T0130 |
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